Jumat, 05 Desember 2014

JMol

Halo teman-teman……terimakasih sudah mengunjungi blog saya. kali ini saya akan menggulas tentang aplikasi kimia yaitu……” Jmol”
nah apa sih jmol itu sebenarnya?
Jmol merupakan sofware visualisasi struktur molekul dalam 3D.
jangan khawatir teman-teman walaupun sangat canggih, aplikasi ini gratis lho…baik banget kan yang bikin jmol. maka dari itu kita harus memanfaatkan aplikasi ini dengan baik. oke….
Selain gratis aplikasi ini kompetabel dengan os windows, mac OS X dan linux/unix. Aplikasi ini bisa didownlod di situs resmi : http://jmol.sourceforge.net/download/.

Setelah diinstal di komputer, saatnya menggunakan aplikasi ini. Penggunaan utama aplikisi ini kan untuk melihat suatu senyawa secara tiga dimensi tetapi selain itu kita juga bisa menggambar dengan menggunakan jmol ini. Untuk melihat suatu senyawa, data base nya bisa di download di PupChem. Senyawa yang kita butuhkan bisa di peroleh dengan mudah dan gratis. Di PupChem tersebut hanya tinggal ketik nama senyawa dan di download file dengan tipe .sdf yang 3D-nya ya.

Sekarang kita akan mencoba menggunakan aplikasi ini. Buka aplikasi Jmol, maka akan muncul tampilan seperti di bawah ini. lalu untuk memulai menggambar molekul adalah klik:

hasilnya adalah:

Kita bisa mengganti sesuai keinginan kita. Semisal ini saya mencoba untuk membuat NH3.

Untuk memberi nama pada setiap atom, klik display lalu klik label dan pilih sesuai yang anda sukai

nah kita bisa melihat bentuk molekul yang kita buat secara 3D, dari sisi depan, atas,bawah, kanan, kiri.caranya :
Klik pada menu View
ini contoh melihat pada sisi depan……